Хромомеры (от хромо... и греч. méros — часть), утолщённые, плотно спирализованные участки дезоксирибонуклеопротеидных нитей (хромонем), из которых состоит хромосома; интенсивно окрашиваются ядерными красителями. Под микроскопом хорошо различимы в профазе мейоза и митоза, имеют вид темноокрашенных гранул, расположенных в определённом порядке (вдоль нити хромосомы). В Хромомеры сосредоточено до 95% всей дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) хромосомы, остальные 5% ДНК содержатся в деспирализованных межхромомерных участках. Форма, размеры и число Хромомеры строго постоянны для каждой хромосомы и образуют картину Хромомеры, имеющую видовую, тканевую и возрастную специфичность. Размеры Хромомеры от 500  до 0,5 мкм у разных организмов, масса ДНК в них соответственно — от 10³ до 10⁶ пар нуклеотидов. У некоторых растений в профазе мейоза обнаружены очень крупные Хромомеры (называемые «узелками»), которые служат чёткими хромосомными маркёрами (метчиками) при цитогенетических исследованиях.

  При образовании гигантских политенных хромосом (см. Политения) гомологичные Хромомеры попарно плотно конъюгируют (сближаются), образуя диски, картина которых (как и картина Хромомеры) специфична для каждой хромосомы. Во многих дисках политенных хромосом путём цитогенетического анализа установлены места расположения (локусы) определённых генов. Классическая генетика рассматривала Хромомеры и диски как цитологические эквиваленты одного или нескольких генов. Большинство современных цитогенетиков считает Хромомеры функциональными единицами хромосомы, включающими структурные гены с регуляторными участками; согласно противоположной гипотезе, Хромомеры—  инактивированные участки хромосомы, не тождественные каким-либо информационным единицам.

  И. И. Кикнадзе.